Algorithmes d’analyse de chaînes codant des macromolécules biologiques: Comparaison, Discrimination, Reconstitution et Prédiction PDF, EPUB

Les amplicons d’Opsine comprenant les séquences codantes pleine longueur ont été excisés à partir d’un gel d’agarose à 1,2% et purifiés à l’aide d’un kit QIAquick Gel Extraction (Qiagen) avant digestion avec 1 U chacune des enzymes de restriction Eco RI et Sal I et repurification avec un kit QIAquick PCR Purification (Qiagen).


ISBN: 6131527180.

Nom des pages: 210.

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Dans ce livre, nous développons de nouveaux algorithmes d’analyse de chaînes de caractères codant des macromolécules biologiques. Nous nous intéressons, particulièrement, aux algorithmes de comparaison de plusieurs chaînes appartenant à la même famille, discrimination entre familles de chaînes, construction d’une sur-chaîne commune à une famille de chaînes, reconstitution d’une séquence d’ADN à partir de ses fragments et prédiction de structures secondaires de macromolécules d’ARN.

Les lysats de protéines ont été préparés en utilisant un tampon RIPA additionné de 1. Comme un outil de calcul pour reconstruire la protéine ancestrale. Les méthodes d’alignement basées sur la structure précédente ignorent souvent la similarité de séquence, l’équivalence structurelle locale et la compacité.

Afin de corriger les différences d’intensité totale des taches d’argent entre les différentes images d’électrophorèse sur gel bidimensionnelles, les quantités de spots protéiques comparés ont été quantifiées en tant que densité optique pour une tache individuelle par intensité protéique totale de toutes les taches du même gel. Le niveau d’expression de la protéine marquée par GFP peut être trop faible. Les réponses génomiques dans les modèles de souris imitent mal les maladies inflammatoires humaines. Les résultats préliminaires indiquent que notre approche basée sur les formes de contexte surpasse les algorithmes de docking rigides basés sur la forme géométrique de pointe tels que ZDOCK (PSC) et PatchDock.